Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FKRPQ9H9S5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FKRPQ9H9S5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FKRPQ9H9S5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FKRPQ9H9S5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms