Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FKRPQ9H9S5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FKRPQ9H9S5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
FKRPQ9H9S5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FKRPQ9H9S5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FKRPQ9H9S5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FKRPQ9H9S5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FKRPQ9H9S5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FKRPQ9H9S5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FKRPQ9H9S5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FKRPQ9H9S5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FKRPQ9H9S5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FKRPQ9H9S5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FKRPQ9H9S5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FKRPQ9H9S5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FKRPQ9H9S5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FKRPQ9H9S5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FKRPQ9H9S5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FKRPQ9H9S5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FKRPQ9H9S5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FKRPQ9H9S5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FKRPQ9H9S5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FKRPQ9H9S5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FKRPQ9H9S5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FKRPQ9H9S5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FKRPQ9H9S5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FKRPQ9H9S5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FKRPQ9H9S5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FKRPQ9H9S5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FKRPQ9H9S5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FKRPQ9H9S5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FKRPQ9H9S5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FKRPQ9H9S5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FKRPQ9H9S5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FKRPQ9H9S5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FKRPQ9H9S5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FKRPQ9H9S5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FKRPQ9H9S5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FKRPQ9H9S5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FKRPQ9H9S5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FKRPQ9H9S5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FKRPQ9H9S5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FKRPQ9H9S5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FKRPQ9H9S5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FKRPQ9H9S5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FKRPQ9H9S5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FKRPQ9H9S5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FKRPQ9H9S5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FKRPQ9H9S5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FKRPQ9H9S5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FKRPQ9H9S5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FKRPQ9H9S5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FKRPQ9H9S5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FKRPQ9H9S5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FKRPQ9H9S5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FKRPQ9H9S5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FKRPQ9H9S5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FKRPQ9H9S5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FKRPQ9H9S5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FKRPQ9H9S5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FKRPQ9H9S5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FKRPQ9H9S5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FKRPQ9H9S5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FKRPQ9H9S5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FKRPQ9H9S5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FKRPQ9H9S5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FKRPQ9H9S5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FKRPQ9H9S5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FKRPQ9H9S5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FKRPQ9H9S5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FKRPQ9H9S5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FKRPQ9H9S5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FKRPQ9H9S5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FKRPQ9H9S5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FKRPQ9H9S5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FKRPQ9H9S5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FKRPQ9H9S5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FKRPQ9H9S5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FKRPQ9H9S5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FKRPQ9H9S5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FKRPQ9H9S5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FKRPQ9H9S5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FKRPQ9H9S5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FKRPQ9H9S5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FKRPQ9H9S5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FKRPQ9H9S5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FKRPQ9H9S5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FKRPQ9H9S5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FKRPQ9H9S5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FKRPQ9H9S5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FKRPQ9H9S5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FKRPQ9H9S5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FKRPQ9H9S5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FKRPQ9H9S5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FKRPQ9H9S5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FKRPQ9H9S5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FKRPQ9H9S5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FKRPQ9H9S5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FKRPQ9H9S5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.7 ms