Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OPN3Q9H1Y3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OPN3Q9H1Y3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN3Q9H1Y3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms