Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUC3BQ9H195 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MUC3BQ9H195 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MUC3BQ9H195 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC3BQ9H195 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms