Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK2Q9H0K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK2Q9H0K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK2Q9H0K1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK2Q9H0K1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms