Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA10Q9GZZ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA10Q9GZZ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA10Q9GZZ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms