Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF518BQ9C0D4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF518BQ9C0D4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF518BQ9C0D4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF518BQ9C0D4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms