Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRY4Q9C004 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRY4Q9C004 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRY4Q9C004 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms