Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM5DQ9BY66 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5DQ9BY66 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5DQ9BY66 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms