Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD1Q9BXT4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD1Q9BXT4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD1Q9BXT4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms