Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C16orf70Q9BSU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C16orf70Q9BSU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C16orf70Q9BSU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C16orf70Q9BSU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms