Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC22CQ9BRL7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC22CQ9BRL7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC22CQ9BRL7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms