Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT3Q9BQG1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYT3Q9BQG1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms