Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGS1Q96RS0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGS1Q96RS0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGS1Q96RS0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGS1Q96RS0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms