Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87BQ96K49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM87BQ96K49 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM87BQ96K49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM87BQ96K49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms