Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LTV1Q96GA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LTV1Q96GA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LTV1Q96GA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LTV1Q96GA3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms