Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIPA1Q96FS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIPA1Q96FS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIPA1Q96FS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIPA1Q96FS4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms