Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC8Q96B26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC8Q96B26 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC8Q96B26 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms