Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC74AQ96AQ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC74AQ96AQ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC74AQ96AQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC74AQ96AQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms