Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102AQ96A19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC102AQ96A19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC102AQ96A19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC102AQ96A19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms