Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC10Q969S8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC10Q969S8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC10Q969S8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms