Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EDAQ92838 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDAQ92838 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDAQ92838 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDAQ92838 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDAQ92838 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDAQ92838 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDAQ92838 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDAQ92838 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDAQ92838 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDAQ92838 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDAQ92838 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDAQ92838 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDAQ92838 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDAQ92838 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDAQ92838 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDAQ92838 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDAQ92838 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDAQ92838 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDAQ92838 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDAQ92838 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDAQ92838 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDAQ92838 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDAQ92838 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDAQ92838 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EDAQ92838 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDAQ92838 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDAQ92838 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDAQ92838 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDAQ92838 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDAQ92838 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDAQ92838 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDAQ92838 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDAQ92838 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDAQ92838 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDAQ92838 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDAQ92838 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDAQ92838 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDAQ92838 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDAQ92838 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDAQ92838 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDAQ92838 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDAQ92838 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDAQ92838 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EDAQ92838 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDAQ92838 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDAQ92838 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDAQ92838 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDAQ92838 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDAQ92838 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDAQ92838 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDAQ92838 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDAQ92838 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDAQ92838 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDAQ92838 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDAQ92838 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EDAQ92838 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDAQ92838 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDAQ92838 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDAQ92838 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDAQ92838 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDAQ92838 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDAQ92838 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDAQ92838 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDAQ92838 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDAQ92838 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDAQ92838 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDAQ92838 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDAQ92838 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDAQ92838 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDAQ92838 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDAQ92838 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDAQ92838 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDAQ92838 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms