Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY2Q8WXA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY2Q8WXA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RUFY2Q8WXA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY2Q8WXA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms