Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RUFY2Q8WXA3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
RUFY2Q8WXA3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
RUFY2Q8WXA3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
RUFY2Q8WXA3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RUFY2Q8WXA3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RUFY2Q8WXA3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
RUFY2Q8WXA3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RUFY2Q8WXA3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RUFY2Q8WXA3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RUFY2Q8WXA3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RUFY2Q8WXA3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RUFY2Q8WXA3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RUFY2Q8WXA3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RUFY2Q8WXA3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RUFY2Q8WXA3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RUFY2Q8WXA3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RUFY2Q8WXA3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RUFY2Q8WXA3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RUFY2Q8WXA3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RUFY2Q8WXA3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RUFY2Q8WXA3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RUFY2Q8WXA3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RUFY2Q8WXA3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RUFY2Q8WXA3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RUFY2Q8WXA3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RUFY2Q8WXA3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RUFY2Q8WXA3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RUFY2Q8WXA3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RUFY2Q8WXA3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RUFY2Q8WXA3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RUFY2Q8WXA3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RUFY2Q8WXA3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RUFY2Q8WXA3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RUFY2Q8WXA3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RUFY2Q8WXA3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RUFY2Q8WXA3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RUFY2Q8WXA3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RUFY2Q8WXA3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RUFY2Q8WXA3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
RUFY2Q8WXA3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RUFY2Q8WXA3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RUFY2Q8WXA3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RUFY2Q8WXA3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RUFY2Q8WXA3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RUFY2Q8WXA3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RUFY2Q8WXA3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RUFY2Q8WXA3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RUFY2Q8WXA3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RUFY2Q8WXA3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RUFY2Q8WXA3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RUFY2Q8WXA3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RUFY2Q8WXA3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RUFY2Q8WXA3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RUFY2Q8WXA3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RUFY2Q8WXA3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RUFY2Q8WXA3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RUFY2Q8WXA3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RUFY2Q8WXA3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RUFY2Q8WXA3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RUFY2Q8WXA3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RUFY2Q8WXA3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RUFY2Q8WXA3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RUFY2Q8WXA3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RUFY2Q8WXA3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
RUFY2Q8WXA3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RUFY2Q8WXA3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RUFY2Q8WXA3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
RUFY2Q8WXA3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RUFY2Q8WXA3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RUFY2Q8WXA3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RUFY2Q8WXA3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RUFY2Q8WXA3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RUFY2Q8WXA3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RUFY2Q8WXA3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RUFY2Q8WXA3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RUFY2Q8WXA3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RUFY2Q8WXA3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RUFY2Q8WXA3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RUFY2Q8WXA3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RUFY2Q8WXA3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RUFY2Q8WXA3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RUFY2Q8WXA3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RUFY2Q8WXA3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RUFY2Q8WXA3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RUFY2Q8WXA3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RUFY2Q8WXA3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RUFY2Q8WXA3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RUFY2Q8WXA3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RUFY2Q8WXA3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RUFY2Q8WXA3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RUFY2Q8WXA3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RUFY2Q8WXA3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RUFY2Q8WXA3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RUFY2Q8WXA3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RUFY2Q8WXA3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RUFY2Q8WXA3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RUFY2Q8WXA3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RUFY2Q8WXA3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
RUFY2Q8WXA3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms