Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCFD1Q8WVM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCFD1Q8WVM8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms