Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC48.49■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.49■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC48.47■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.46■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC48.46■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.46■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC48.44■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC48.44■■■■■ 5.35
RB1CC1Q8TDY2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC48.43■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC48.39■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
RB1CC1Q8TDY2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC48.38■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC48.38■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC48.38■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC48.36■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC48.36■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC48.34■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC48.33■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
RB1CC1Q8TDY2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC48.3■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.3■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC48.3■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC48.3■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC48.26■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.32
RB1CC1Q8TDY2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.22■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
RB1CC1Q8TDY2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC48.19■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.3
RB1CC1Q8TDY2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC48.12■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC48.12■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC48.08■■■■■ 5.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms