Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP1Q8TDR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF3IP1Q8TDR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms