Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNL1Q8NG31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNL1Q8NG31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNL1Q8NG31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms