Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP43Q8NFH3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP43Q8NFH3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP43Q8NFH3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP43Q8NFH3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms