Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID1BQ8NFD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID1BQ8NFD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID1BQ8NFD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID1BQ8NFD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms