Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
USP32Q8NFA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP32Q8NFA0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP32Q8NFA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP32Q8NFA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms