Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT2Q8NAT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMGNT2Q8NAT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMGNT2Q8NAT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMGNT2Q8NAT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POMGNT2Q8NAT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT2Q8NAT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMGNT2Q8NAT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms