Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ANKRD35Q8N283 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ANKRD35Q8N283 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms