Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ANKRD35Q8N283 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ANKRD35Q8N283 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ANKRD35Q8N283 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ANKRD35Q8N283 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ANKRD35Q8N283 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ANKRD35Q8N283 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ANKRD35Q8N283 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ANKRD35Q8N283 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ANKRD35Q8N283 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ANKRD35Q8N283 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ANKRD35Q8N283 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ANKRD35Q8N283 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ANKRD35Q8N283 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ANKRD35Q8N283 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ANKRD35Q8N283 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ANKRD35Q8N283 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ANKRD35Q8N283 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ANKRD35Q8N283 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ANKRD35Q8N283 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ANKRD35Q8N283 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ANKRD35Q8N283 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ANKRD35Q8N283 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ANKRD35Q8N283 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ANKRD35Q8N283 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ANKRD35Q8N283 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ANKRD35Q8N283 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ANKRD35Q8N283 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ANKRD35Q8N283 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ANKRD35Q8N283 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ANKRD35Q8N283 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ANKRD35Q8N283 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ANKRD35Q8N283 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ANKRD35Q8N283 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ANKRD35Q8N283 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ANKRD35Q8N283 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ANKRD35Q8N283 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ANKRD35Q8N283 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ANKRD35Q8N283 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ANKRD35Q8N283 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ANKRD35Q8N283 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ANKRD35Q8N283 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ANKRD35Q8N283 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ANKRD35Q8N283 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ANKRD35Q8N283 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ANKRD35Q8N283 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ANKRD35Q8N283 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ANKRD35Q8N283 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ANKRD35Q8N283 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ANKRD35Q8N283 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ANKRD35Q8N283 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ANKRD35Q8N283 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ANKRD35Q8N283 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ANKRD35Q8N283 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ANKRD35Q8N283 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ANKRD35Q8N283 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ANKRD35Q8N283 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ANKRD35Q8N283 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ANKRD35Q8N283 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ANKRD35Q8N283 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ANKRD35Q8N283 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ANKRD35Q8N283 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ANKRD35Q8N283 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ANKRD35Q8N283 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ANKRD35Q8N283 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ANKRD35Q8N283 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ANKRD35Q8N283 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ANKRD35Q8N283 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ANKRD35Q8N283 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ANKRD35Q8N283 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ANKRD35Q8N283 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ANKRD35Q8N283 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ANKRD35Q8N283 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ANKRD35Q8N283 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ANKRD35Q8N283 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ANKRD35Q8N283 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ANKRD35Q8N283 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ANKRD35Q8N283 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ANKRD35Q8N283 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ANKRD35Q8N283 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ANKRD35Q8N283 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ANKRD35Q8N283 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ANKRD35Q8N283 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ANKRD35Q8N283 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ANKRD35Q8N283 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ANKRD35Q8N283 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ANKRD35Q8N283 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ANKRD35Q8N283 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ANKRD35Q8N283 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ANKRD35Q8N283 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ANKRD35Q8N283 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ANKRD35Q8N283 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ANKRD35Q8N283 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ANKRD35Q8N283 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ANKRD35Q8N283 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ANKRD35Q8N283 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ANKRD35Q8N283 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ANKRD35Q8N283 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ANKRD35Q8N283 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ANKRD35Q8N283 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms