Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX8Q7RTT4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSX8Q7RTT4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX8Q7RTT4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX8Q7RTT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms