Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYFIP1Q7L576 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYFIP1Q7L576 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CYFIP1Q7L576 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms