Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY3Q7L099 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY3Q7L099 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUFY3Q7L099 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms