Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK3Q6PHR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK3Q6PHR2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK3Q6PHR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms