Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGMBQ6NW40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGMBQ6NW40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGMBQ6NW40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGMBQ6NW40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGMBQ6NW40 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.6 ms