Protein–RNA interactions for Protein: Q5T442

GJC2, Gap junction gamma-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC2Q5T442 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC2Q5T442 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC2Q5T442 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJC2Q5T442 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJC2Q5T442 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJC2Q5T442 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJC2Q5T442 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC2Q5T442 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJC2Q5T442 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC2Q5T442 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC2Q5T442 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC2Q5T442 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC2Q5T442 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC2Q5T442 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC2Q5T442 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC2Q5T442 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms