Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CEP170Q5SW79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CEP170Q5SW79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CEP170Q5SW79 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CEP170Q5SW79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CEP170Q5SW79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms