Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCTE1Q5JU00 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCTE1Q5JU00 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCTE1Q5JU00 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms