Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC23Q53EV4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC23Q53EV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms