Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNDC1Q4ZHG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNDC1Q4ZHG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms