Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTC1Q2NKJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTC1Q2NKJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms