Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 26.72□□□□□ -1.339e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.419e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.429e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)6□□□□□ -1.459e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.599e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 23.7□□□□□ -1.829e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.99e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 21.5
SRSF7Q16629 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 21.5
SRSF7Q16629 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-12■■■■□ 21.5
SRSF7Q16629 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-12■■■■□ 21.5
SRSF7Q16629 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.774e-12■■■■□ 21.5
SRSF7Q16629 TPM3-218ENST00000505010 540 ntTSL 27.77□□□□□ -1.174e-12■■■■□ 21.5
SRSF7Q16629 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.722e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 CAD-211ENST00000491891 662 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.229e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 212.83□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 210.94□□□□□ -0.669e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.779e-7■■■■□ 21.4
SRSF7Q16629 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 21.3
SRSF7Q16629 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.42e-8■■■■□ 21.3
SRSF7Q16629 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.422e-8■■■■□ 21.3
SRSF7Q16629 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.472e-8■■■■□ 21.3
SRSF7Q16629 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.512e-8■■■■□ 21.3
SRSF7Q16629 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 513.98□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-218ENST00000584261 510 ntTSL 34.86□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-206ENST00000578137 857 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 DDX42-211ENST00000580108 545 ntTSL 33.47□□□□□ -1.851e-6■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.775e-11■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.418e-7■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.428e-7■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.438e-7■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.313e-7■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-7■■■■□ 21.2
SRSF7Q16629 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.372e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 417.86■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 215.25■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-203ENST00000411792 560 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-210ENST00000475995 751 ntTSL 512.56□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-211ENST00000451765 643 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 21.1
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SRSF7Q16629 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-15■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 NDUFA13-206ENST00000511584 640 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 510.66□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 310.16□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-214ENST00000494047 1393 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-206ENST00000427785 485 ntTSL 310.01□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-208ENST00000447345 785 ntTSL 29.49□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-202ENST00000392481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-201ENST00000296273 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-210ENST00000449502 799 ntTSL 38.15□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 PRDX6-202ENST00000460950 809 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 DDX42-204ENST00000577940 1427 ntTSL 56.83□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 PRDX6-203ENST00000470017 859 ntTSL 26.41□□□□□ -1.382e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 45.06□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-204ENST00000420673 682 ntTSL 24.82□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-224ENST00000495003 568 ntTSL 24.57□□□□□ -1.682e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-205ENST00000422552 382 ntTSL 54.38□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 24.1□□□□□ -1.752e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 XPO1-210ENST00000449444 579 ntTSL 43.58□□□□□ -1.842e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 RFC4-205ENST00000418288 701 ntTSL 23.41□□□□□ -1.862e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 21.1
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