Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIK5Q16478 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIK5Q16478 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIK5Q16478 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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