Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B3Q15393 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B3Q15393 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B3Q15393 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
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