Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKD1Q15139 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKD1Q15139 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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