Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFTN1Q14699 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFTN1Q14699 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN1Q14699 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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